Ново проучване за шизофрения се фокусира върху протеиново-протеиновите взаимодействия

Подобно на хората, за гена може да се научи много, като се погледне компанията, която той поддържа и се следи как се държи. В опит да разкрият повече улики за развитието на шизофрения, изследователи от Медицинския факултет на Университета в Питсбърг изследват как протеините, произведени от гени, свързани с шизофрения, взаимодействат помежду си.

„Можем да заключим какво може да направи протеинът, като проверим компанията, която поддържа“, каза старши изследовател Мадхави Ганапатираджу, доктор по медицина, асистент по биомедицинска информатика, Медицинско училище в Пит.

„Например, ако знам, че имате много приятели, които играят хокей, това може да означава, че и вие се занимавате с хокей. По същия начин, ако видим, че неизвестен протеин взаимодейства например с множество протеини, участващи в невронната сигнализация, има голяма вероятност неизвестният обект също да участва в същото. "

В най-новата история учените са провели много проучвания за асоцииране в целия геном (GWAS), които успешно са идентифицирали генни варианти, свързани с повишен риск от шизофрения. Въпреки това, сравнително малко се знае за протеините, които тези гени произвеждат, какво правят и как си взаимодействат, казват изследователите.

„Проучванията на GWAS и други изследователски усилия ни показаха кои гени могат да имат значение при шизофренията“, каза Ганапатираджу. „Това, което направихме, е следващата стъпка. Опитваме се да разберем как тези гени са свързани помежду си, което може да ни покаже биологичните пътища, които са важни за болестта. "

Накратко, всеки ген произвежда протеини и тези протеини обикновено взаимодействат помежду си в биологичен процес. Изучаването на това как тези протеини се държат един с друг може да хвърли светлина върху ролята на ген, който все още не е проучен, разкривайки пътища и биологични процеси, свързани с шизофренията, както и връзката му с други сложни заболявания.

След разработването и използването на нов изчислителен модел, наречен High-Precision Protein Interaction Prediction (HiPPIP), изследователите откриха повече от 500 нови протеин-протеинови взаимодействия (PPI), свързани с гени, свързани с шизофренията.

Изследователите добавят, че докато свързаните с шизофрения гени, идентифицирани в исторически план и чрез GWAS, имат малко припокриване, моделът показва, че те споделят повече от 100 общи взаимодействия. Констатациите могат да доведат до по-добро разбиране на биологичните основи на това психично заболяване, както и да посочат пътя към лечението.

Констатациите се публикуват онлайн през npj шизофрения, списание на Nature Publishing Group.

Източник: Университети в Питсбърг Училища на здравните науки